未払い残業代の支払いについて

いつも参考にさせて頂いております。
今回は弊社の未払い残業代についてご相談させて頂きたいと思います。
弊社は、本社には管理部機能のみ、あとの営業部等は別の場所にあります。
この別の場所にいるものの勤怠管理について、現在システム上のタイムシートが存在し、従業員は日々、それに時間を記入していくことになっております。
それに加えて、毎月月末になると、そのタイムシートを元に残業時間の申請を紙で提出し、本人の捺印をして上長に提出・承認をして人事部に提出することになっています。
人事部では、システムのタイムシートと残業時間の申請書を照らし合わせ、残業が発生している場合には時間外手当を支払ってきました。
ただ今回営業所に立ち寄った際、従業員の日報を見たのですが、それによるとシステムのタイムシートとは明らかに異なる、かなりの時間の残業が発生していることがわかりました。（日報は営業所保管です）
従業員に聞くと、「めんどくさいから申請しなかった」と言っています。
このことを経営層に話したところ、「法律違反はまずいので、支払うべきものは支払うが、どこまで支払うべきか調べろ」といわれました。
おそらく、他の営業所でも同様の申請漏れがあると思われます。
（総従業員数は600名弱です）
この場合、どこまでを支払い対象にすべきか、ご相談させてください。
宜しくお願い致します。

投稿日：2008/01/31 11:18　ID：QA-0011185