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給与支払報告書・総括表の普通徴収/特別徴収について

給与支払報告書・総括表を電子で提出します。
提出先が100ほどあり、その中には非課税基準が100万以下・97万以下・93万以下など混在しています。
利用する電子システムは自動判定できないのですが、やはり提出先にあわせて普通徴収・特別徴収を判定して提出しなければいけないでしょうか。

従業員数も多いため、100万以下は普通徴収・それ以外(退職予定など除く)は特別徴収で提出したいと考えていますが、もし93万以下の市町村が含まれていた場合、特別徴収の義務違反などになってしまうでしょうか。

全員を特別徴収にすることも考えましたが、90~100万くらいのパートが数百名おり、年の途中に退職する方が多いため異動届がたくさん発生してしまうと思いますので避けたいです。

実務的にどうすべきか悩んでいます。
何卒よろしくお願い申し上げます。

投稿日:2026/01/16 09:30 ID:QA-0163174

papamiさん
東京都/販売・小売(企業規模 301~500人)

本Q&Aは法的な助言・診断を行うものではなく、専門家による一般的な情報提供を目的としています。
回答内容の正確性・完全性を保証するものではなく、本情報の利用により生じたいかなる損害についても、『日本の人事部』事務局では一切の責任を負いません。
具体的な事案については、必ずご自身の責任で弁護士・社会保険労務士等の専門家にご相談ください。

プロフェッショナル・人事会員からの回答

全回答2

プロフェッショナルからの回答

米倉 徹雄
米倉 徹雄
KIZASHIリスキリング社会保険労務士法人 代表社員

回答いたします

ご質問について、回答いたします。 給与支払報告書の作成や税務上の判断は税理士が専門領域となりますが、 実務上、100万…

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投稿日:2026/01/16 10:56 ID:QA-0163188

相談者より

ご回答ありがとうございました。
93万か100万かよく考えて決めようと思います。

投稿日:2026/01/16 11:59 ID:QA-0163209大変参考になった

回答が参考になった 0

プロフェッショナルからの回答

井上 久
井上 久
井上久社会保険労務士・行政書士事務所 代表

ご回答申し上げます。

ご質問いただきまして、ありがとうございます。 次の通り、ご回答申し上げます。 本件は、給与支払報告書提出時の「普通徴収・特別徴収の区分判断」を、市町村ごとの非課税基準に合わせる必要…

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投稿日:2026/01/16 10:57 ID:QA-0163189

相談者より

ご回答ありがとうございました。
100万ではなく念のため93万とするかよく考えてみようと思います。

投稿日:2026/01/16 12:05 ID:QA-0163210大変参考になった

回答が参考になった 0

本Q&Aは法的な助言・診断を行うものではなく、専門家による一般的な情報提供を目的としています。
回答内容の正確性・完全性を保証するものではなく、本情報の利用により生じたいかなる損害についても、『日本の人事部』事務局では一切の責任を負いません。
具体的な事案については、必ずご自身の責任で弁護士・社会保険労務士等の専門家にご相談ください。



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