試用期間中の退職願提出について

お世話になります。
検索しましたが、似たような事案を見つけることが出来ませんでしたので、ご教授下さい。

正職員で雇用しましたが、当初から欠勤が多く（主に本人の家族の都合）、最終的には自身も病気となり１週間ほどの欠勤の申出後に、部署の責任者宛てに退職願と診断書が送られてきました。
退職日については、入職当初に１ヶ月間の猶予を以って提出する旨伝えていましたので、記入日から１ヶ月後の日付となっています。
本人に連絡し、退職日の件や社会保険料の話をしたいと考えましたが、着信拒否のため全くつながらない状況です。
ここで質問ですが・・・
　退職日については、業務引継や年休消化等を想定し１ヶ月程の猶予としていますが、病気の場合は就労不能であれば、直近の月末や欠勤後の翌日の出勤日に出勤できなければ、その日にしていました。（あくまで本人と面談など行った結果としてですが・・・）
　今回は、電話で欠勤を申出、その後に退職願を郵送し、連絡も取れない状況で、あまりにも一方的な対応ではないかと思います。このまま、１ヶ月間の欠勤とした場合、勤務できていない状況であれば、本人負担の社会保険料も徴収できない可能性があります。
　このようなケースの場合ですが以下の対応は問題になるのかご教授いただければと思います。（ちなみに入職初月は出勤率７割、翌月は１割もありません。）

１．社会保険料の支払いを命じ、期日までに支払いを行わない場合で連絡も全く行わず、支払の意思を示さない場合、退職日を会社が決め、退職手続を行い、その旨通知する。（引き続き支払いの督促は行うとしても、徴収できない分についてはあきらめることになっても仕方ないと考えます。）
２．退職願は既に提出されているので、その指定された日までは在籍扱いにするしかない。たとえ社会保険料の支払いがなくても、それは事業所が被るしかない。（厚生年金や退職共済含みます。）

上記以外しか思いつきません。
無断欠勤１４日間のルールはありますが、試用期間中で、欠勤中であり、どのように対応すべきか苦慮しています。メンタル面の不調でもあり、強引な連絡などは逆効果であったり、そのことで悪化したと言われるのではないかと考えると、思い切った行動に出ることも躊躇されます。（面接では心身ともに健康であると言っていましたが、まさかこんなことになるとは・・・）

大変分かりづらい文面で申し訳ありませんが、何とか打開策を立てたいと考えておりますので、そのヒントだけでもいただきたく存じます。
宜しくお願いします。
　

投稿日：2019/05/22 14:23　ID：QA-0084527