住民票異動に伴う海外赴任者の源泉所得税・住民税の取扱について

お世話になっております。現在、海外に赴任中の従業員の税について質問させて下さい。
以下に、箇条書きにて状況説明を致します。

１：今年４月１日付で海外へ赴任。それに伴い、住居のある地元自治体へ転出届を提出した。
　　(赴任期間は２年を予定)
２：会社は、年の中途で非居住者になったとして、３月３１日をもって年末調整を行った。
３：その後、当該従業員が、上記１の自治体の補助金を受給すべく、住民票を海外赴任地から
　　元に戻した。
　　(受給要件が、｢補助金の申請者が、住民票に記載されている者｣とあるので)
４：当該従業員は引き続き海外にて就業中。赴任期間の変更の予定は、今のところ無い。
５：給与は日本の本社から、国外勤務に対するものとして支給。赴任後、源泉所得税の控除は行っていない。

以上となります。この場合、税の取扱はどのようにすればよいのでしょうか。
源泉税・住民税両方について、教えて頂ければと思います。よろしくお願いします。

投稿日：2014/10/17 15:54　ID：QA-0060550