３６協定の労働時間算出について

当社では３６協定の特別条項付時間を１ヶ月４５時間としております。
この時間を算出するにあたり、現状では日々の残業時間の合計を適用しております。
この超過作業時間の算出について、月間の総労働時間で算出することは可能でしょうか。
例として
・月間の営業日数２０日
・一日の所定労働時間　７．５時間　
の場合所、１ヶ月の定労働時間は１５０時間となります。
社員の１ヶ月の勤務状況が
・当月の残業時間５０時間
・当月の有給休暇取得日数５日
の勤務の場合
総労働時間は　（２０日－５日）＊７．５時間＋５０時間＝１６２．５時間
となり、月間での超過時間は１２．５時間となります。

現状では残業時間が５０時間のため３６協定違反として対応しておりますが、総労働時間で考えた場合、このようなケースは対象外として扱ってよいのでしょうか。
またこのような対応をするために必要となるルール等があるのでしょうか。

現状では代休取得を奨励しておりますが、社員からの有休申請を拒否することはできないため、このような対応をとっております。
なお残業手当の削減、減額は全く考えておりません。上記例についても５０時間相当分の残業手当を支給します。

フレックスタイム制度は導入しておりません。社員の安全衛生面を考慮した合、総労働時間で考えるべきかと思い質問させていただきます。
ご教示の程よろしくお願いいたします。

投稿日：2011/11/29 11:32　ID：QA-0047170